コンテンツマネジメントシステム（CMS）では、文字コードがEUC-JPなので、トラックバックすると相手方で文字化けをしてしまいます。

そこで、NucleusのサイトからUTF-8の新しいバージョンを持ってきて、インストールするのがいいと思います。

ただし、プラグインは、CMSに入っているものが新しくて、あちらこちらからダウンロードしてこなくてよいので、これをあらかじめ、保存しておくといいでしょう。

結局、トータルすると、一度CMSでインストールし、設定をしないで、nucleus/pluginsのフォルダを保存し、その後一度削除し、新しいバージョンをインストール。