単純ですが、Googleで検索した件数です。

MovableType 2,640,000
tDiary 2,600,000
WordPress 1,390,000
Nucleus 1,150,000

有名なのはこんなところでしょうか。

MovableTypeはいうまでもないのですが、tDiary関連のページが結構あるのは意外でした。
また、WordPressはXoopsのモジュールとして使われていますが、単体の使用は少ないかもしれません。
ウェブ全体(世界中)で使われているのは、MovableType→Nucleus→WordPressという順でしょう。

Nucleusはトラックバック機能がプラグインということで、設置に手間がかかります。
便利なのはWordPressでしょうか。ただし、テーマを日本語に対応させるのに手間がかかるので、一長一短です。

他にもポピュラーなブログツールがあれば、コメントしてください。